Первое, это надо определиться что вы хотите делать с компьютером и той суммой денег, которой вы распологаете.
Если вы хотите просто "полазить" в интернете и посмотреть кино, особо много вам рекомендовать не буду. Купите себе экономный вариант материнской платы, как, например, AsRock, у которой соотношение цены и качества довольно неплохое. Поставте не очень мощный процессор на неё. Не покупайте заманчивые в цене PcChips или BioStar т.к. качество у них даже не поддаётся критике.
Если вы средний пользователь и требуете многофункциональности компьютера, стоит заострить внимание на быстродействии.
Если вы "Помешанный Gamer", то следующие критерии для вас.

1. Быстродействие материнской платы напрямую зависит от модели chipset-а. Конечно, я не могу предоставить полный перечень хороших chipset-ов, но могу назвать самых выдающихся на данный момент: KT333, KT880, Nforce2, KT600. Для AMD и Intel с окончанием на PERL - это одни из самых-самых. На самом деле их не много, но не припомню всех сразу (как, наверное, вы заметили, я назвал точные имена чипов для AMD и не сделал этого для Intel. Это объясняется тем, что процессоры AMD проявляют себя с лучшей стороны в играх чем Intel). Итак, мы определились в чипсете (отзывы и информацию об определённых чипах вы можете раздобыть на сайтах специализирующихся на Hardware, или у нас на форуме в разделе "Железо". Мы с радостью вам поможем с выбором.
2. Один небольшой, но важный пункт - это наличие вентилятора на чипсете. Охлаждение это очень важный фактор для стабильности и скорости работы вашего оборудования.
3. Стабильность работы платы можно узнать по одному определяющему фактору: ёмкость конденсаторов-стабилизаторов. Далее я приведу пример взгляда "железячника" на близкий к идеалу motherboard:
Это Soyo КТ333 Ultra Dragon Platinum Edition.

Рассмотрим ее подробнее: конденсаторы имеют ёмкость в 4800 микрофарад. Это очень хорошо. В настоящее время такие производители как Asus, MSI и ниже по классу, ставят конденсаторы около 2000-2200 микрофарад, что состовляет меньше половины от идеального. Значит смело можно сказать, что стабильность уменьшается в 2 раза.

Наблюдается вентилятор, установленный на чипе. Это очередной плюс.

Присутствуют пять подключений для вентиляторов, каждый из которых имеет мониторинг, что означает оповещение о застрявшем вентиляторе в любом из 5-и подключений.

ATX-питание не очень удобно расположенно, провода могут перекрывать проход воздуха к вентилятору ЦП, хотя этот минус не очень существен. Кусочком клейкой ленты на этих проводах можно решить проблему.

Тоже немаловажно что есть аж 14 конденсаторов для стабилизации питания на плате. Стоит заметить, что конденсаторы довольно высокого качества.

Следующий пункт - расширение: материнская плата должна иметь как можно меньше интегрированных плат. Ни в коем случае не должно быть видеоплаты. Они очень сильно забивают ОЗУ, и процессор часто ждёт, пока ОЗУ и видеоплата обмениваются информацией. На этой плате есть: USB, IDE RAID, Soundcard 5.1, Smart card reader. Довольно маленькое количество девайсов. Огромным плюсом является присутствие RAID-контроллера, позволяющего подключить 8 IDE устройств. IDE RAID-контроллер очень сильно увеличивает overall perfomance - два одинаковых жёстких диска могут читать и писать одновременно, увеличивая скорость в два раза (RAID массив 0 уровня). Все прекрасно знают, что HDD - это самый медленный девайс из всего железа компьютера. Также возможно использовать режим "зеркало", когда оба жёских диска заполняются идентичными данными, и, если один выходит из строя, ни один байт информации не будет потерян (RAID 1-го уровня). Компания Soyo была одна из самых первых в удачной попытке интеграции данного контроллера.

Это самые важные пункты для "активных" пользователей. Повторим их вкратце:
1. Расширение
2. Стабилизация
3. Скорость
4. Архитектура
5. (покажется абсурдом, но на практике проверенно): вид самой платы может немало рассказать о её работоспособности. Можно просто рассудить: если компания не уделила внимания внешнему виду, можно ли расчитывать на её надёжность?

Теперь пункт для overclocker-ов. Буду здесь краток т.к. дело это опасное и те, кто занимается этим профессионально, знают что нужно, а те кто начинает - вот пожалуйста:
1. Охлаждение. Уделять внимание на наличие всевозможных радиаторов и вентиляторов на всей плате.
2. BIOS features (опции в BIOS). Наличие опции Dynamic oveclocking. Без него, пожалуй, не стоит трогать.
3. Вентиляция самого корпуса и вентилятора на процессоре. Но это уже тема для отдельной статьи.

Вот в принципе и всё, что могу посоветовать начинающим "разгонщикам". Ещё раз напоминаю: прежде чем сделать, спросите или прочитайте книгу, т.к. неаккуратными действиями можете сжечь всё.

В заключение. Перед покупкой проверьте свои финансовые возможности, затем посмотрите доступные по цене платы, определитесь для чего вам нужен компьютер. Закончив с этими пунктами переходим к выбору. Плата должна иметь приличый внешний вид. Затем заглядываем на ёмкость конденсаторов: написана она сбоку этих "бочек". Смотрим на наличие радиаторов. Внимательно все разгядите чтобы потом не было проблем с расширением. Спросите в интернете хороший ли вами выбран chipset. И, наконец, если вы хотите производительность, следите за размером платы: менее чем 5 PCI-слотов или урезанная в размере плата это не совсем хорошо.

Выбор этот ответственный, спросите знающих людей перед покупкой (не спрашивайте продавцов, их проблема - это продать, зачастую им не важно что).

Могу посоветовать 5 компаний производителей отличных материнских плат:
1. Soyo
2. Gigabyte
3. Epox
4. Intel
5. Chaintech

Удачи в выборе!