Autorun 9.12
Позволяет просканиривать и редактировать практически весь автозапуск
http://technet.microsoft.com/en-us/sysinternals/bb963902.aspx

FileMon for Windows v7.04
Позволяет отслеживать обращения всех процессов к файловой системе
http://technet.microsoft.com/en-us/sysinternals/bb896642.aspx

RegMon for Windows v7.04
Позволяет отслеживать обращения всех процессов к реестру
http://technet.microsoft.com/en-us/sysinternals/bb896652.aspx

Rootkit Unhooker LE 3.8.340.550
На данный момент самый лучший антируткит
http://dump.ru/file_catalog/1006853

RemoteDLL 1.3
позволяет подгружать и выгружать библиотеки из процессов
http://www.securityxploded.com/remotedll.php

Advanced Process Termination v4.2 - DiamondCS
Наверное лучший убийца процессов, позволяет это делать различными способами
http://dump.ru/file_catalog/1006872

WinServiceManager
Удобный менеджер служб Windows
http://www.securityxploded.com/winservicemanager.php

0x4553-Intercepter
Сниффер сетевой активности
http://intercepter.nerf.ru/

Process Monitor v1.37
Отличная замена TaskManager, с возможность построения дерева процессов
http://technet.microsoft.com/en-us/sysinternals/bb896645.aspx

Антивирусная утилита AVZ - 4.30
http://z-oleg.com/secur/avz/download.php

FileAlyzer© 1.6.0.4
Инструмент для просмотра и анализа содержимого файлов
Включая файловые потоки!!!
http://www.safer-networking.org/files/filealyz.exe

mst IsUsedBy
маленькая утилитка котороя позволяет узнать каким процессом занят файл
http://dump.ru/file_catalog/1006913

Unlocker 1.8.7
позволяет удалить заблокированные (используемые) файлы
[link=http://ccollomb.free.fr/unlocker/#download]http://ccollomb.free.fr/unlocker/#download[/link]